Omega Virus: Prologue is een real-time tableau-bouwend kaartspel, dat zich afspeelt in de wereld van The Omega Virus. Elke speler krijgt een identiek kaartspel met gebieden van de Battlesat terwijl die uiteengereten wordt.
Tegelijkertijd onthullen de spelers, in real time, de bovenste kaart van hun deck en spelen die voor zich uit, waardoor een plattegrond ontstaat. Door specifieke "kamers" te maken kan een speler "sleutels" verzamelen, en met deze sleutels kan een speler de "vergrendelde" kaarten van zijn stapel in zijn plattegrond spelen. Elk van deze vergrendelde kaarten bevat een stuk kritieke uitrusting. Vind alle drie de stukken om de ronde te winnen, en verdien punten voor het eerste zijn en voor het voltooien van ronde doelstellingen. Na drie ronden wint de speler met de meeste punten.
